المخططات التفرعية وأشجار النشوء والتطور – بناؤها من الصفات أو التسلسلات

ماذا تعرض

يجمع المخطط التفرعي الكائنات الحية وفق الصفات المشتقة المشتركة: وهي سمات ظهرت في سلف مشترك وانتقلت إلى جميع أحفاده. وتُظهر المجموعة الخارجية الحالة السلفية، فهي التي تحدد جذر الشجرة. وتعمل البيانات الجزيئية بالطريقة نفسها: الأنواع التي تختلف تسلسلات DNA أو البروتين فيها أقل اختلاف تتشارك أحدث سلف مشترك. تبني هنا الأشجار بالطريقتين، من مصفوفة صفات ومن تسلسلات مصطفّة محاكاة، ثم تقارنها بالشجرة المعتمدة. وتحوّل الساعة الجزيئية المعايَرة بتاريخ أحفوري الاختلافاتِ إلى أزمنة تباعد، ويمكن اختبار مجموعات تقليدية مثل الزواحف أو بدائيات النوى على الشجرة.

طريقة الاستخدام

اختر «مجموعة البيانات». في بيانات الصفات انقر خلية للتبديل بين 0 و 1، أو ألغِ تحديد عمود لاستبعاد صفة، أو غيّر «المجموعة الخارجية»؛ وبدّل بين «مخطط تفرعي» و«مجموعات متداخلة». في بيانات التسلسلات اضبط الطول، ثم انقر أصغر رقم في جدول الاختلافات أو اضغط «اجمع الزوج الأقرب» حتى تكتمل الشجرة. فعّل «قارن بالشجرة المعتمدة»، واختر معايرة للساعة الجزيئية، ثم اختر «مجموعة» لاختبارها.

المعاملات القابلة للتغيير

• مجموعة البيانات الفقاريات (صفات), النباتات (صفات), الرئيسيات (تسلسلات DNA), الفقاريات (بروتين), النطاقات الثلاثة (تسلسلات rRNA)
• طول التسلسل 20–1000 موقع
• إظهار الشجرة المعتمدة للمقارنة

أسئلة للاستكشاف

1. لماذا تحتاج إلى مجموعة خارجية لتحديد أي حالة للصفة هي الحالة المشتقة؟
2. لماذا تختلف أحيانًا الأشجار المبنية من تسلسلات قصيرة عن الشجرة المعتمدة؟
3. لماذا لا تشكّل بدائيات النوى فرعًا حيويًا على شجرة الحياة ذات النطاقات الثلاثة؟