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Cladogramas e árvores filogenéticas – construa a partir de caracteres ou sequências

BiologiaEvoluçãoIdades 17–18

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Construa um cladograma a partir de uma tabela de caracteres derivados compartilhados, enraizado com um grupo externo, ou a partir de sequências alinhadas de DNA e proteínas: conte as diferenças, una passo a passo o par mais próximo e compare sua árvore com a aceita. Um relógio molecular converte as diferenças em tempos de divergência; mostre a árvore nos três domínios e teste se grupos tradicionais são monofiléticos, parafiléticos ou polifiléticos.

Aula: Evidências da evolução: cladogramas, árvores filogenéticas e relógio molecular

O que mostra

Um cladograma agrupa organismos por caracteres derivados compartilhados: características que surgiram em um ancestral comum e passaram a todos os seus descendentes. O grupo externo mostra o estado ancestral, por isso enraíza a árvore. Dados moleculares funcionam da mesma forma: espécies cujas sequências de DNA ou proteína diferem menos têm o ancestral comum mais recente. Aqui você constrói árvores dos dois jeitos, a partir de uma matriz de caracteres e de sequências alinhadas simuladas, e as compara com a árvore aceita. Um relógio molecular calibrado com uma data fóssil converte diferenças em tempos de divergência, e você pode testar grupos tradicionais como répteis ou procariontes.

Como usar

Escolha um Conjunto de dados. Com caracteres, toque em uma célula para alternar 0 e 1, desmarque uma coluna para retirar um caractere ou mude o Grupo externo; alterne entre Cladograma e Conjuntos aninhados. Com sequências, defina o comprimento e toque no menor número da tabela de diferenças, ou pressione Unir o par mais próximo, até completar a árvore. Marque Comparar com a árvore aceita, escolha uma calibração para o relógio molecular e um Grupo para testar.

Parâmetros que você pode mudar

  • Conjunto de dados Vertebrados (caracteres), Plantas (caracteres), Primatas (sequências de DNA), Vertebrados (proteína), Três domínios (sequências de rRNA)
  • Comprimento das sequências 20–1000 posições
  • Mostrar a árvore aceita para comparar

Perguntas para explorar

  1. Por que você precisa de um grupo externo para decidir qual estado de um caractere é derivado?
  2. Por que árvores feitas com sequências curtas às vezes diferem da árvore aceita?
  3. Por que os procariontes não formam um clado na árvore da vida de três domínios?

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