Cladogramas y árboles filogenéticos – constrúyelos a partir de caracteres o secuencias
BiologíaEvoluciónEdades 17–18
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Inicia sesión para usarConstruye un cladograma a partir de una tabla de caracteres derivados compartidos, enraizado con un grupo externo, o a partir de secuencias alineadas de ADN y proteínas: cuenta las diferencias, une paso a paso el par más cercano y compara tu árbol con el aceptado. Un reloj molecular convierte las diferencias en tiempos de divergencia; muestra el árbol sobre los tres dominios y comprueba si los grupos tradicionales son monofiléticos, parafiléticos o polifiléticos.
Lección: Pruebas de la evolución: cladogramas, árboles filogenéticos y reloj molecular
Qué muestra
Un cladograma agrupa organismos por caracteres derivados compartidos: rasgos que aparecieron en un antepasado común y pasaron a todos sus descendientes. El grupo externo muestra el estado ancestral, así que sirve de raíz del árbol. Los datos moleculares funcionan igual: las especies cuyas secuencias de ADN o proteínas difieren menos comparten el antepasado común más reciente. Aquí construyes árboles de las dos maneras, desde una matriz de caracteres y desde secuencias alineadas simuladas, y los comparas con el árbol aceptado. Un reloj molecular calibrado con una fecha fósil convierte diferencias en tiempos de divergencia, y puedes poner a prueba grupos tradicionales como los reptiles o los procariotas.
Cómo usarla
Elige un Conjunto de datos. Con caracteres, toca una celda para cambiar 0 y 1, desmarca una columna para quitar un carácter o cambia el Grupo externo; alterna entre Cladograma y Conjuntos anidados. Con secuencias, fija la longitud y toca el número más pequeño de la tabla de diferencias, o pulsa Unir el par más cercano, hasta completar el árbol. Marca Comparar con el árbol aceptado, elige una calibración para el reloj molecular y un Grupo para comprobar.
Parámetros que puedes cambiar
- Conjunto de datos Vertebrados (caracteres), Plantas (caracteres), Primates (secuencias de ADN), Vertebrados (proteína), Tres dominios (secuencias de ARNr)
- Longitud de las secuencias 20–1000 posiciones
- Mostrar el árbol aceptado para comparar
Preguntas para explorar
- ¿Por qué necesitas un grupo externo para decidir qué estado de un carácter es derivado?
- ¿Por qué los árboles hechos con secuencias cortas a veces difieren del árbol aceptado?
- ¿Por qué los procariotas no forman un clado en el árbol de la vida de tres dominios?
