Simulic
Bahasa Indonesia

Struktur DNA dan RNA 3D – dari nukleotida hingga nukleosom

BiologiGenetikaUsia 17–18

Memuat…

Gunakan di kelas saya ✨ Sesuaikan dengan AI Laporkan masalah

Model 3D DNA yang dapat diputar: nukleotida (fosfat, gula, basa) bergabung melalui ikatan fosfodiester menjadi untai 5′→3′, dan dua untai antiparalel membentuk heliks ganda putar kanan dengan pasangan A–T (2 ikatan hidrogen) dan G–C (3 ikatan), alur mayor dan minor, 10,5 pb per putaran, serta lebar 2 nm. Anda dapat mengubah urutan basa dan melihat tabel jumlah basa menurut aturan Chargaff, membandingkan DNA dengan RNA serta kromosom prokariota dengan eukariota, dan menjelajahi nukleosom dan serat kromatin, ditambah Foto 51 simulasi dan percobaan Hershey–Chase. Tersedia juga tampilan diagram 2D.

Pelajaran: Struktur DNA dan RNA; nukleotida, pasangan basa komplementer, dan aturan Chargaff; kromosom prokariota dan eukariota; nukleosom

Yang ditunjukkan

DNA adalah polimer nukleotida; setiap nukleotida terdiri atas fosfat, gula deoksiribosa, dan basa nitrogen. Reaksi kondensasi menghubungkan nukleotida dengan ikatan fosfodiester menjadi untai yang memiliki ujung 5′ dan ujung 3′. Dua untai antiparalel melilit menjadi heliks ganda putar kanan yang diikat oleh ikatan hidrogen antara basa komplementer: A dengan T (dua ikatan) dan G dengan C (tiga). Setiap pasangan menggabungkan purin dan pirimidin, sehingga lebar heliks 2 nm, dengan jarak 0,34 nm per pasangan dan sekitar 10,5 pasangan per putaran. Pada eukariota, sekitar 147 pb melilit setiap oktamer histon membentuk nukleosom.

Cara menggunakan

Di Heliks ganda, ketik urutan basa atau klik pasangan basa untuk menggantinya, lalu bandingkan baris tabel basa untuk menguji aturan Chargaff. Di Nukleotida, tambahkan basa satu per satu dan hitung ikatan serta molekul air. Gunakan DNA vs RNA dan Kromosom untuk membandingkan struktur. Di Nukleosom, atur DNA penghubung, tekan Catat hasil, lalu bandingkan baris. Di Sejarah, geser kontrol Foto 51 dan jalankan Hershey–Chase dengan Langkah berikut.

Parameter yang dapat diubah

  • Layar Heliks ganda DNA, Nukleotida dan untai tunggal, DNA dibandingkan dengan RNA, Kromosom prokariota dan eukariota, Nukleosom dan serat kromatin, Sejarah penemuan
  • Tampilan 3D (dapat diputar), 2D (diagram datar)
  • Urutan untai 1 (5′→3′, hanya A, T, G, C; 4–40 nukleotida)
  • Pasangan basa per putaran heliks 10,5 (DNA dalam larutan, 3,6 nm per putaran), 10 (nilai dibulatkan, 3,4 nm per putaran)
  • Tampilkan ikatan hidrogen
  • Tingkat pengemasan di layar Nukleosom (1 = satu nukleosom, 2 = serat 10 nm, 3 = serat 30 nm) 1–3
  • Panjang DNA penghubung antarnukleosom 10–90 pb
  • Ada histon H1
  • Kromosom eukariota yang dibandingkan dengan E. coli Kromosom 1 manusia, Kromosom 21 manusia, Kromosom IV khamir
  • Jumlah plasmid dalam sel bakteri 0–5
  • Bagian sejarah Difraksi sinar-X (Foto 51), Percobaan Hershey–Chase
  • Penanda radioaktif (percobaan Hershey–Chase) ³²P (menandai DNA), ³⁵S (menandai protein)

Pertanyaan untuk dijelajahi

  1. Jika sampel DNA mengandung 30% adenin, berapa persen basanya yang berupa guanin?
  2. Mengapa DNA yang kaya pasangan G–C memerlukan suhu lebih tinggi untuk memisahkan untainya?
  3. Bagaimana jumlah nukleosom per 10.000 pb berubah ketika DNA penghubung makin panjang?

Simulasi terkait