Simulic
Bahasa Indonesia

Asam amino: bentuk ion menurut pH, titik isoelektrik dan ikatan peptida

KimiaBiomolekul dan polimerUsia 17–18

Simulic.comMemuat…

Gunakan di kelas saya

Pada mode ion, geser penggeser pH dari 0 hingga 14 dan amati struktur asam amino berubah seketika — kation dalam asam, ion zwitter di sekitar titik isoelektrik, anion dalam basa; batang fraksi dan muatan rata-rata dihitung dari nilai pKa nyata, dan molekul bermigrasi menuju katode atau anode dalam medan listrik, diam tepat pada pI-nya. Pada mode peptida, pilih jumlah residu lalu tekan Jalankan untuk melihat asam amino tersambung melalui ikatan –CO–NH–, masing-masing melepaskan satu molekul air.

Pelajaran: Asam amino: sifat amfoter, bentuk ion zwitter, titik isoelektrik; peptida dan ikatan peptida

Yang ditunjukkan

Asam amino memiliki gugus asam –COOH dan gugus basa –NH₂ sehingga bersifat amfoter dan terutama berada sebagai ion zwitter. Muatannya bergantung pada pH: di bawah titik isoelektrik (pI) kation dominan, di atasnya anion dominan, dan pada pI muatan rata-ratanya nol. Simulasi menghitung fraksi setiap bentuk dari nilai pKa nyata dan mengaitkannya dengan elektroforesis, yaitu molekul bermuatan bergerak ke elektrode yang berlawanan muatan. Rantai samping yang asam atau basa, seperti pada asam glutamat dan lisin, menggeser pI menjauhi netral. Setiap ikatan peptida yang terbentuk melepaskan satu molekul air.

Cara menggunakan

Dengan Konten pada Bentuk ion vs pH dan elektroforesis, pilih Asam amino lalu geser pH larutan perlahan dari 0 sampai 14 sambil mengamati struktur, batang fraksi, dan arah migrasi. Tekan Ke pI untuk melihat titik saat molekul berhenti bergerak, lalu bandingkan lisin dengan asam glutamat. Ubah Konten ke Pembentukan ikatan peptida, atur jumlah residu, dan tekan Jalankan untuk menghitung molekul air yang dilepaskan.

Parameter yang dapat diubah

  • Asam amino Glisin (pI 5,97), Alanin (pI 6,00), Lisin (pI 9,74), Asam glutamat (pI 3,22)
  • pH larutan 0–14
  • Konten Bentuk ion vs pH dan elektroforesis, Pembentukan ikatan peptida
  • Jumlah residu asam amino dalam rantai 2–5 residu

Pertanyaan untuk dijelajahi

  1. Pada pH 7, bentuk lisin mana yang dominan dan ke elektrode mana lisin bermigrasi?
  2. Mengapa pI asam glutamat jauh lebih rendah daripada pI glisin?
  3. Berapa ikatan peptida terbentuk dan berapa molekul air dilepaskan saat pentapeptida terbentuk, dan bagaimana pengaruhnya terhadap massa molarnya?

Simulasi terkait